Á¦¸ñ |
½Ç½Ã°£ ÁßÇÕÈ¿¼Ò ¿¬¼â¹ÝÀÀ (Real-time QPCR)À» ÀÌ¿ëÇÑ Çϼö½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈ ¹Ì»ý¹° Á¤·®Ã¼°è ±¸Ãà |
¿ø¹® |
ÆÄÀÏ÷ºÎ ÂüÁ¶ |
Á¦ÀÛÀÏ |
|
¹ßÇà³âµµ |
|
Á¦ÃâÀÏ |
|
[ÃÊ·Ï]
¥°. Á¦ ¸ñ
½Ç½Ã°£ ÁßÇÕÈ¿¼Ò ¿¬¼â¹ÝÀÀ(Real-time QPCR)À» ÀÌ¿ëÇÑ Çϼö½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈ ¹Ì»ý¹° Á¤·®Ã¼°è ±¸Ãà
¥±. ¿¬±¸°³¹ßÀÇ ¸ñÀû ¹× Çʿ伺
»çȸ±â¹Ý½Ã¼³ÀÇ ÇϳªÀÎ Çϼöµµ ¹× °ü·Ã ½Ã¼³ÀÇ º¸±ÞÀÌ Áõ´ëµÇ¸é¼ Çϼö󸮷®ÀÌ Áö ¼ÓÀûÀ¸·Î Áõ°¡µÇ°í ÀÖÀ¸¸ç ÀÌ¿¡ µû¶ó ±¹³» Çϼö½½·¯ÁöÀÇ ¹ß»ýÀÌ Áö¼ÓÀûÀ¸·Î Áõ°¡ Ãß ¼¼ÀÌ´Ù. Çϼö½½·¯ÁöÀÇ ÀûÀýÇÑ °ü¸®¸¦ À§Çؼ´Â Áö±Ý±îÁö Çϼöó¸®Àå¿¡¼ ÃÖÁ¾ ¹ß»ý µÈ ½½·¯Áö¸¦ ó¸®ÇÏ´Â ¹æ½Ä¿¡¼ Å»ÇÇÇÏ¿© ó¸® °øÁ¤ Áß ½½·¯Áö¸¦ ÃÖ´ëÇÑ ÀÚ¿øÈ ¶Ç´Â ÀçÀÌ¿ëÇÏ¿© ÃÖÁ¾ ¹èÃâµÇ´Â ½½·¯ÁöÀÇ ¾çÀ» °¨¼Ò½ÃÅ°´Â ¹æ½ÄÀ¸·Î ÀüȯµÉ ÇÊ¿ä°¡ ÀÖ´Ù.
Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤Àº ½½·¯Áö¿¡ Æ÷ÇÔµÈ À¯±â¹°À» ½ÅÀç»ý¿¡³ÊÁöÀÎ ¸Þź°¡½º·Î ÀüȯÇÏ¸é¼ ½½·¯Áö ¹ß»ý·®Àº È£±â¼º ó¸®ÀÇ 1/5¢¦1/10¿¡ ºÒ°úÇÑ Ã»Á¤ ½½·¯Áö °¨·®È ±â¼úÀÌ´Ù. ±×·¯³ª Çø±â¼ÒÈ ¹Ì»ý¹°ÀÇ º¹Àâ´Ù¾ç¼º°ú Çø±â¼º ±â¼ú ºÎÁ·À¸·Î ÀÎÇÏ¿© Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤ÀÇ Á¤È®ÇÑ ¸ð´ÏÅ͸µ ¹× Á¤¼º․Á¤·® ºÐ¼®¹ýÀÌ ½Ç¿ëÈµÈ ¹Ù ¾ø´Â ½ÇÁ¤ÀÌ´Ù.
º» ¿¬±¸¿¡¼´Â PCR-DGGE¿Í QPCR µîÀÇ Ã·´Ü »ý¸í°øÇбâ¼ú(BT)À» µµÀÔÇÏ¿© Çø±â¼º ȯ°æ»ý¹°°øÁ¤¿¡ ´ëÇÑ ÀÌÇØÀÇ Æø°ú ±íÀ̸¦ Çâ»ó½Ãų ¼ö ÀÖ´Â ¹Ì·¡Çü ȯ°æ»ý¸í°øÇбâ¼ú (Environmetal Bio-Technology, EBT)ÀÇ °³¹ßÀ» ÅëÇØ Çϼö½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤ÀÇ È¿À² °³¼±°ú °øÁ¤ ¾ÈÁ¤¼º Á¦°í¸¦ ¸ñÀûÀ¸·Î ÇÏ¿´´Ù.
¥². ¿¬±¸°³¹ßÀÇ ³»¿ë ¹× ¹üÀ§
½½·¯ÁöÀÇ Ã³¸®․ÀÚ¿øȸ¦ À§ÇÑ Çø±â¼ÒÈ°øÁ¤ÀÇ È¿À² ±Ø´ëȸ¦ À§ÇÑ ¹Ì»ý¹° ±ºÁý ±¸Á¶ ¹× °³Ã¼¼ö¸¦ ü°èÀûÀ¸·Î Á¤·®ÇÒ ¼ö ÀÖ´Â QPCR¿ë primer-probe setÀÇ °³¹ß ¹× °øÁ¤ ÀÀ¿ë ±â¼úÀ» µµÃâÇÏ´Â °ÍÀ» ÃÖÁ¾ ¸ñÇ¥·Î ÇÏ¿´´Ù. À̸¦ À§ÇØ ÃÑ 3´Ü°èÀÇ ¼øÂ÷ÀûÀÎ ¿¬ ±¸¸¦ ÅëÇØ ÃÖÁ¾ÀûÀ¸·Î
1. °èÅë¹ß»ýÇÐÀû 16S rRNA gene°ú functional geneÀÇ Æ¯À̼ºÀ» ÀÌ¿ëÇÑ Çø±â¼ÒÈ ¹Ì»ý¹° ´ë»ó QPCR¿ë primer-probe set °³¹ß(¿ä¼Ò ±â¼ú)
2. °³¹ßµÈ QPCR¿ë primer-probe setÀ» ÀÀ¿ëÇÑ Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤ÀÇ population dynamics ¹× »ýÀ忪Çаè¼ö »êÃâ(ÀÀ¿ë ±â¼ú)
3. ½Ç±Ô¸ð ½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈÁ¶ÀÇ ÁÖ±âÀû ¸ð´ÏÅ͸µÀ» ÅëÇÑ population dynamics ¹× °ø Á¤º¯¼ö¿ÍÀÇ Åë°èÇؼ®(È®´ë±â¼ú) À» °³¹ßÇÏ´Â °ÍÀ» ¼¼ºÎ ¸ñÇ¥·Î ÇÏ°í ÀÖ´Ù.
¥³. ¿¬±¸°³¹ß°á°ú
1. 1Â÷³âµµ 1Â÷³âµµ¿¡´Â ¸Þź»ý¼º±Õ°ú bacteriaÀÇ °èÅëºÐ·ùÇÐÀû ºÐ·ù¿¡ ±Ù°ÅÇÑ 9Á¾ÀÇ QPCR¿ë primer-probe setÀ» °³¹ßÇÏ¿´À¸¸ç, ´Ù¾çÇÑ Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤¿¡ Àû¿ëÇÏ¿´´Ù.
(Ç¥. 9Á¾ÀÇ QPCR¿ë primer-probe set °³¹ß ³»¿ë)
2. 2Â÷³âµµ 2Â÷³âµµ¿¡´Â ½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈÀÇ ÁÖ¿ä »ê»ý¼º±ÕÀ» ´ë»óÀ¸·Î ÇÑ 4Á¾ÀÇ set°ú functional gene¿¡ ƯÀÌÀûÀÎ 3Á¾ÀÇ setÀ» Ãß°¡·Î °³¹ßÇÏ¿´°í ÀÀ¿ëÁ¶°ÇÀ» È®¸³ÇÏ¿´´Ù.
(Ç¥. 7Á¾ÀÇ QPCR¿ë primer-probe set °³¹ß ³»¿ë)
3. 3Â÷³âµµ ½ÇÇè½Ç±Ô¸ð ½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤¿¡¼ ¸Þź»ý¼º±Õ ±×·ì¿¡ ´ëÇÑ »ýÀ忪Çаè¼ö¸¦ »êÃâÇÏ¿´´Ù. ȸºÐ½Ä ¿îÀü¿¡¼´Â MMB, MSL ±×·ìÀ» ´ë»óÀ¸·Î ÇÏ¿´À¸¸ç ¼öÄ¡ÇعýÀ» ÀÌ¿ëÇÏ¿´°í, ¿¬¼Ó½Ä ¿îÀü¿¡¼´Â ARC ±×·ìÀ» ´ë»óÀ¸·Î ÇÏ¿´À¸¸ç Çؼ®ÇعýÀ» ÀÌ¿ëÇÏ¿´´Ù.
(Ç¥. »ýÀ忪Çаè¼ö »êÃâ ³»¿ë)
½ÇÇè½Ç±Ô¸ð ½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤¿¡¼ ¿ìÁ¡ ¸Þź»ý¼º±ÕÀ» PCR-DGGE¸¦ ÅëÇØ °üÂûÇÏ¿´´Ù. À̶§ »óÀ§ ARC setÀ» ÀÌ¿ëÇÏ´Â °Íº¸´Ù ÇÏÀ§ order-level setÀ» ÀÌ¿ëÇÑ DGGE °á°ú°¡ Á¾´Ù¾ç¼º Ãø¸é¿¡¼ ¿ì¼öÇÔÀÌ È®ÀεǾú´Ù.
(Ç¥. ¸Þź»ý¼º±Õ Á¤¼ººÐ¼® ³»¿ë)
Æ÷Ç׽à Çϼöó¸®Àå ½Ç±Ô¸ð ½½·¯Áö Çø±â¼ÒÈ °øÁ¤¿¡ ´ëÇÏ¿© 2005³â 5¿ùºÎÅÍ 2006³â 12¿ù±îÁö ÃÑ 19ȸÀÇ ¿ùº° ¸ð´ÏÅ͸µÀ» ÇÏ¿´´Ù. DNA ÃßÃâ¹ýÀ» È®¸³ÇÏ°í, °øÁ¤º¯
[¿ø¹® ÆÄÀÏ÷ºÎ ÂüÁ¶] |